Organismos geneticamente modificados (OGMs) são uma tecnologia alimentar relativamente nova. Nesse processo, os genes das plantas são modificados para serem resistentes a vários herbicidas, produzirem seus próprios pesticidas e produtos químicos farmacêuticos e, às vezes, "terminarem", ou seja, serem incapazes de se reproduzir. Seu cultivo é um assunto altamente controverso, pois os efeitos ambientais, de saúde e nutricionais a longo prazo de culturas geneticamente modificadas são desconhecidos. Alguns países europeus e o Condado de Marin nos EUA proibiram seu cultivo. Milho, uma das culturas comerciais mais cultivadas, também é um dos OGMs mais comuns. Milho OGM é encontrado em inúmeros produtos comerciais, muitos para consumo humano. Em 2011, estimava-se que 80% do milho cultivado nos EUA era transgênico.
Um uso para o milho que se tornou mais comum no início do século XXI é seu uso como aditivo de combustível. Etanol, um tipo de álcool, é produzido a partir de milho e adicionado à gasolina para uso em automóveis. Em fevereiro de 2011, o USDA desregulamentou o uso de milho OGM para produção de etanol, decisão que provavelmente levará a mais uso de milho OGM. O uso de etanol como combustível é controverso porque, em 2011, exigia mais energia para cultivar o milho e produzir o etanol do que o produto final fornece.
Xarope de milho rico em frutose é um adoçante comum derivado do milho. Enzimas são usadas para alterar e intensificar os açúcares naturais do milho. É usado em alimentos processados, como refrigerantes, sucos, pães, carnes processadas, cereais, iogurtes e sorvetes. Se um alimento contendo xarope de milho não for orgânico, pode muito bem conter milho OGM.
Milho é uma ração comum para gado, frequentemente alimentado a ruminantes, ou animais que ruminam, como vacas. O milho é triturado e fermentado por agricultores em silagem, uma ração à base de milho que os animais comem. Milho também é usado como enchimento em ração para animais de estimação. Qualquer um desses produtos pode conter milho OGM.
Como uma das culturas comerciais mais comuns, o milho é ingrediente principal ou de enchimento em incontáveis alimentos. Qualquer produto alimentício não orgânico que contenha milho pode potencialmente conter milho OGM. Estes incluem, mas não se limitam a: cerveja, chips de milho, cascas de taco, tortilhas, cereais, barras de granola, hambúrgueres vegetais e misturas para pão de milho. Entre o milho usado como enchimento e o xarope de milho rico em frutose como adoçante, uma quantidade significativa de alimentos processados não orgânicos contém milho, grande parte do qual é OGM.