As doenças que os produtores agrícolas monitoram dependem da cultura. Algumas das culturas de maior rendimento são milho, soja, trigo e alfafa. Doenças nessas culturas incluem podridão de sementes, podridão de raízes, ferrugem da soja, ferrugem comum, podridão de espiga, podridão de colmo, fusariose da espiga e haste preta da primavera.
Pragas que os produtores monitoram incluem pulgões, lesmas, ácaros-aranha de duas manchas, besouro-do-feijão-mexicano, cigarrinha-da-batata, gorgulho-da-alfafa, lagartas-rosca, besouro-da-folha-do-cereal e mosca-de-hessian.
Para controlar doenças, os produtores devem rotacionar culturas, melhorar drenagem do solo, plantar híbridos de alto rendimento, controlar insetos, controlar ervas daninhas e testar o solo. Fungicida e/ou herbicida podem ser aplicados se necessário.
O controle de pragas é manejado por rotação de culturas, controle de ervas daninhas e plantio de híbridos. Antes de aplicar pesticida, os campos devem ser inspecionados com a praga identificada e contada. Deve atender aos níveis de invasão do Departamento de Agricultura dos EUA antes que a aplicação seja justificada.
Produtores agrícolas, privados e comerciais, devem participar de seminários de treinamento para se tornarem certificados na aplicação de pesticidas.
O USDA também atua no controle de pragas e doenças, fazendo esforços nacionais na erradicação do Besouro Esmeralda do Freixo e prevenção da propagação da Gripe Aviária.