Pepinos contêm cucurbitacina, composto que em alta concentração dá sabor amargo. Mais presente nas sementes e casca que na polpa. Pode causar "arroto de pepino" (arrotos excessivos) em algumas pessoas. Evita-se descascando e removendo sementes. Existem variedades "sem arroto" com menos cucurbitacina. Arroto é incômodo mas não afeta seriamente a digestão.
Ricos em vitaminas C e A, minerais: magnésio, potássio, sílica. Também folato, manganês, molibdênio (nutrientes essenciais menores). Alta fibra dietética — auxilia digestão e regularidade.
Sementes são levemente diuréticas: promovem fluxo urinário e estimulam rins a eliminar resíduos e depósitos gordurosos. Diuréticos podem desidratar, mas alto teor de água do pepino neutraliza isso.
Usadas holisticamente para tratar tênia e reputadas por efeito regenerador na pele.
Para quem não tolera cucurbitacina, existem variedades sem sementes (sementes disponíveis em várias empresas e supermercados).