Pesticidas são comuns no abastecimento alimentar. Os pesticidas matam insetos que podem danificar ou até destruir safras inteiras de alimentos. Para remover alguns pesticidas residuais, a FDA recomenda lavar completamente todas as frutas e vegetais antes do consumo. Estimam que 83% dos pesticidas podem ser removidos simplesmente lavando o alimento primeiro.
A acrilamida foi descoberta pela primeira vez em alimentos em 2002. É uma substância cristalina branca que é cancerígena e causa danos nervosos em animais de laboratório quando consumida em altas doses. A FDA ainda não determinou seu efeito na saúde pública.
Bifenilos Policlorados (PCBs) são liberados no ar de aterros contendo equipamentos elétricos antigos. PCBs também podem resultar da evaporação de corpos d'água contaminados contendo resíduos de dispositivos elétricos.
Deoxinivalenol (DON) é um mofo tóxico presente em alguns produtos de trigo. A substância pode ser reduzida mas não removida quando o trigo é processado. Acredita-se que DON não apresenta risco à saúde pública.
Certas "impurezas orgânicas" encontradas nos alimentos que consumimos incluem pelos de roedores, fezes e urina, bem como fragmentos de insetos, ovos e larvas. É impossível remover todas as impurezas dos alimentos, então a FDA estabeleceu níveis máximos aceitáveis para minimizar riscos à saúde. Muitas das impurezas orgânicas que consumimos são pequenas partículas microbianas e acredita-se que não causam riscos à saúde.
Muitas pessoas consomem o que é rotulado como alimentos "naturais" ou "orgânicos" porque se acredita que esses alimentos são mais seguros e saudáveis, já que o alimento é natural e não processado. No entanto, alimentos naturais contêm maiores quantidades de impurezas orgânicas. Quanto mais o alimento é processado, mais contaminantes orgânicos são destruídos. Alimentos rotulados 100% puros não o são, pois são apenas tão puros quanto precisam ser para passar nos requisitos da FDA para venda ao público.
Não gostamos de pensar em alimentos processados como saudáveis, mas o processamento de alimentos ajuda a eliminar alguns dos químicos e pesticidas que afetam nossos alimentos. Os resultados de dois estudos separados indicam que 83% de benomil — um fungicida — é removido de maçãs quando processadas em purê de maçã. Laranjas processadas em suco viram redução de 98% de benomil e 86% de benomil foi removido de tomates processados em suco.
Em 1862, Charles Wetherill foi nomeado pelo Presidente Abraham Lincoln para chefiar o Bureau of Chemistry, predecessor da FDA. A FDA como a conhecemos hoje começou com a aprovação da Lei de Alimentos e Medicamentos Puros de 1906 e é responsável por proteger a saúde pública. Como não há como eliminar completamente contaminantes dos alimentos, a FDA teve que estabelecer diretrizes aceitáveis usando análise química para determinar níveis de contaminantes que não resultarão em risco à saúde.