Abraham Lincoln lançou o USDA em 1862 para disseminar educação, ideias e tecnologia a comunidades agrícolas. Lincoln queria que América rural se beneficiasse de energia a vapor e outros desenvolvimentos da revolução industrial. Mas em 1905, o USDA expandiu sua missão quando Upton Sinclair publicou "A Selva", romance descrevendo condições horríveis nos matadouros de Chicago. No ano seguinte, o USDA criou o Serviço de Inspeção e Segurança Alimentar para garantir saúde e segurança de produtos agrícolas destinados ao consumidor.
A Lei de Inspeção de Carne de 1906 estabeleceu requisitos para inspeções na indústria de embalagem de carne. Inspectores devem examinar todos animais antes do abate e separar os que mostram sinais de doença. Também devem garantir abate humanitário, inspecionar cada carcaça após abate e carimbar ou marcar todos produtos que passam inspeção. A lei também estabelece padrões sanitários para matadouros que trabalhadores do USDA devem fazer cumprir.
A Lei de Inspeção de Produtos Avícolas de 1957 exige inspectores do USDA verifiquem galinhas, patos, gansos, perus e pintadas durante abate e processamento. O objetivo principal é manter produtos avícolas adulterados fora da cadeia alimentar. Porém, inspectores também devem garantir que usinas atendam padrões sanitários do USDA. Devem também garantir que produtos aprovados sejam classificados e rotulados.
Americanos comem cerca de 80 bilhões de ovos por ano e aproximadamente 30% são comprados como produtos de ovos processados. Em 1970, o Congresso autorizou USDA a conduzir inspeções de ovos em casca e produtos processados. Em usinas que manuseiam ovos inteiros, inspectores verificam limpeza e garantem armazenamento na temperatura adequada. Inspeções requeridas a cada três meses. USDA supervisiona continuamente processo de quebra e pasteurização em usinas de produtos de ovos. Inspectores também devem garantir que rótulos de produtos de ovos são precisos.
O USDA criou o Serviço Federal de Inspeção de Grãos em 1976 para avaliar e certificar qualidade de grãos para mercados domésticos e internacionais. Embora a agência inspecione grãos desde 1916, o FGIS estabeleceu padrões consistentes. Inspectores testam amostras de grãos de lotes armazenados em elevadores e armazéns. Também verificam pesos de lotes e inspecionam condições de instalações de armazenamento. Após inspeção, FGIS emite certificado para marketing do produto.