A principal razão para evitar reutilizar recipientes plásticos é que eles podem ser criadouros de bactérias. Geralmente são difíceis de limpar adequadamente e não são próprios para lava-louças. Como as pessoas normalmente não os limpam completamente entre os usos, as bactérias na garrafa podem ficar para proliferar. Este problema é exacerbado se a garrafa for deixada em um ambiente quente ou carro quente. Essas bactérias em crescimento podem causar doenças em quem continua a beber da garrafa.
Muitas pessoas acreditam que garrafas plásticas descartáveis começam a liberar químicos com o uso repetido, mas, segundo a FDA, não há evidências para apoiar isso. Garrafas plásticas descartáveis são feitas de tereftalato de polietileno (PET), que não contém os químicos encontrados em algumas outras formas de plástico que se acredita contribuírem para taxas de câncer.
Embora possa parecer uma escolha mais ecológica reutilizar garrafas plásticas, a maioria dos ambientalistas sugere que é melhor não comprar bebidas em garrafas plásticas. Mesmo se reutilizadas, elas acabam no lixo, ao contrário de suas contrapartes de vidro que podem ser reutilizadas e relavadas vezes sem conta.