Terapia de reposição hormonal para aliviar sintomas da menopausa ou para outros propósitos aumenta ligeiramente riscos dos usuários para desenvolver problemas cardiovasculares sérios e câncer. TRH também pode causar muitos efeitos colaterais indesejados, variando de dor no estômago a infecções. Seja formulada como cremes, adesivos ou comprimidos - ou contendo estrogênio, estriol ou combinação de estrogênio e progestin - todas TRH têm os mesmos riscos e efeitos colaterais.
TRH alivia ondas de calor, mudanças de humor, suores noturnos e secura vaginal que vêm com início da menopausa. Suplementos hormonais femininos também podem retardar perda óssea (osteoporose) e prevenir desenvolvimento de câncer de cólon.
Conforme listado na informação de prescrição para Premarin, formulação em comprimido de estrogênios conjugados comercializada pela Wyeth, mulheres usando TRH mais frequentemente experienciaram dor abdominal, dor nas costas, gases, coceira (prurido), cãibras nas pernas, sangramento vaginal, corrimento vaginal (leucorreia), vaginite, fraqueza e falta de energia (astenia), e infecções por fungos (monilíase vaginal) como efeito colateral durante ensaios clínicos do produto.
Outros efeitos colaterais da TRH incluíram calvície, crescimento de pelos corporais, descoloração facial (cloasma e melasma), pressão arterial elevada, erupção cutânea (por exemplo, eritema multiforme), espessamento do revestimento uterino (hiperplasia endometrial) e amarelamento da pele e olhos (icterícia colestática).
Mulheres que usam TRH têm riscos ligeiramente aumentados para coágulos sanguíneos, câncer de mama, demência, doença da vesícula biliar, ataques cardíacos e AVC. Também, mulheres com útero intacto estão em risco aumentado para desenvolver câncer endometrial quando tomam estrogênio suplementar.
Para diminuir chance de experienciar efeitos colaterais e problemas a longo prazo, o FDA aconselha mulheres a usar menor dose de TRH que forneça benefícios desejados e limitar tempo que tomam suplementos de estrogênio. A agência recomenda ainda avaliar necessidade de TRH a cada 3 a 6 meses. Após revisar toda literatura clínica sobre TRH, editores do Consumers Report escreveram em outubro de 2008 que mulheres que tiveram câncer de mama, diabetes, doença cardíaca, pressão alta, colesterol alto, câncer ovariano, câncer uterino ou histórico familiar de mortes por causas cardiovasculares não devem usar TRH.