Comprimidos de vinagre de maçã são altamente ácidos e podem causar doenças digestivas: indigestão, azia, náusea. Qualidade corrosiva do ácido pode danificar esmalte dentário e tecidos do esôfago.
Uso prolongado pode levar a osteoporose e perda óssea, além de deficiência de potássio, especialmente em quem toma insulina.
Vinagre de maçã pode ter interações adversas com insulina, diuréticos e medicamentos para insuficiência cardíaca congestiva. Consulte médico antes de tomar se usa medicamentos.