Seqüenciais Chip Protocolos

imunoprecipitação da cromatina sequencial , conhecido como SeqChIP , é um teste biológico destinado a definir as formas como duas proteínas interagem dentro de uma região de um ácido desoxirribonucléico (DNA) vertente. Pesquisadores envolver um conjunto específico de tarefas encomendadas para revelar três possíveis relações entre proteínas em avaliação . Tal como acontece com a maioria dos testes de ciências, que seres com limpeza e termina com a conclusão . De acordo com pesquisadores de Harvard , os avanços tecnológicos em análise SeqChIP pode permitir aos cientistas estudar de forma mais ampla os fenômenos biológicos . Prepare

experimentos SeqChIP conter uma preparação cuidadosa , a fim de higienizar e limpar as esferas magnéticas para experimento. Os pesquisadores devem lavar as contas várias vezes e limpá-los em solução " bloco " . Os grânulos são , em seguida, suspensa por secagem e re - lavada . Geralmente , os cientistas deixar um dia antes da lavagem final antes de avançar para a fase de ligação. Dada a natureza da variável cadeias de ADN para a avaliação , esta fase de preparação também varia em complexidade . No entanto, uma verdade científica permanece: o limpador do teste, o limpador o resultado

Crosslink

Cientistas selecionar complexos de DNA de proteínas, ou áreas na costa, para o realce . com um anticorpo . Com efeito , os biólogos justapor proteínas , a fim de observar suas interações. Uma vez observados , cross- link precisa ser confirmada em ordem inversa. Será que as proteínas se relacionam ainda quando a seqüência é invertida ? SeqChIP cientistas acreditam que a co- existência de ambas as proteínas , quando avaliada na direção oposta fornecem evidências convincentes de co- ocupação completa, e permitir a diferenciação inequívoca de ocupação parcial e não co- ocupação.

Purify

Polymerase Chain Reaction , ou " PCR , " é um processo de amplificação do DNA que verifica a qualidade ou pureza de DNA. A PCR é realizada em três fases . Em primeiro lugar , a PCR derrete os fios separados pelo aumento da temperatura . Em seguida , os pesquisadores trazer as duas vertentes de modelos de volta junto com iniciadores de PCR . Finalmente , os biólogos incubar o DNA para que primers polimerase causar células em análise de cluster. A partir daí , os pesquisadores se deslocar para a análise dos clusters.
Avaliar

análise examina as fitas de DNA para detectar a presença ou ausência de " ocupação ", uma relação interativa entre proteínas . Duas proteínas que sempre associamos com o mesmo fragmento de DNA tem total co- ocupação , sem co- ocupação ocorre quando as proteínas só podem associar em sub-populações mutuamente exclusivas da cadeia de DNA , co- ocupação parcial significa que algumas moléculas de DNA têm tanto proteínas , enquanto que os outros têm uma ou a outra . Se o teste é um procedimento SeqChIP na vertente da biologia , ele fornece aos cientistas a possibilidade de aplicar os resultados singulares a uma estrutura genômica inteira.