Também chamada hiperpermeabilidade intestinal, está ligada a colite, doença de Crohn, doença celíaca, intestino irritável, artrite, doença hepática, pancreatite, alergias e mais. O intestino delgado deve maximizar absorção de nutrientes e bloquear toxinas. Dois terços do sistema imunológico estão no intestino delgado; qualquer desequilíbrio tem grandes repercussões. Na síndrome, o revestimento intestinal (células enterocitárias) desenvolve lacunas, permitindo passagem de toxinas para a corrente sanguínea, gerando doença.
Embora não sejam cura, probióticos podem proporcionar alívio substancial. A terapia com probióticos dietéticos é frequentemente recomendada para tratar esta síndrome difícil de diagnosticar e tratar.