O Centro Nacional de Ética em Saúde considera ética como "disciplina que considera o que é certo e o que deve ser feito diante de incerteza ou conflito sobre valores". O campo de administração de saúde supervisiona aspectos não diretamente assistenciais da medicina, e tem grande responsabilidade em navegar interesses frequentemente conflitantes entre questões médicas, econômicas, sociais e científicas que cercam o cuidado ao paciente.
Um dos principais papéis de administradores de saúde é manter a confidencialidade de registros de pacientes e outros documentos privados. A Lei Federal de Portabilidade e Responsabilidade de Seguros de Saúde de 1996 criou estrutura legal para proteger informações de saúde privadas nos EUA. No entanto, administradores de saúde ainda precisam encontrar equilíbrio entre divulgação e confidencialidade. Como o Colégio Americano de Executivos de Saúde nota em sua declaração de confidencialidade de 2009, pacientes devem se sentir seguros ao revelar informações altamente pessoais, enquanto em troca administradores e provedores devem criar ambiente que ofereça segurança e proteção.
Tradução e compreensão formam grande componente da ética em administração de saúde. Administradores frequentemente ocupam posição de ter que traduzir conceitos técnicos, científicos e burocráticos para pacientes de origens diversas, habilidades linguísticas e crenças. Parte da função de administração de saúde é garantir que todos os documentos e formulários que pacientes leem ou preenchem sejam apresentados de forma clara e concisa, e não contenham terminologia inexplicada ou enganosa. Um dos desafios éticos particulares inerentes a este papel é garantir que interesses concorrentes, por exemplo, entre pesquisadores científicos ou empresas farmacêuticas, não impeçam pacientes de receber cuidado adequado e tomar decisões informadas.
Pesquisa envolvendo pacientes como sujeitos é forma comum de testar e desenvolver novos tratamentos e fazer avanços médicos. Administração de saúde desempenha papel crítico em supervisionar ensaios clínicos e outras formas de pesquisa com sujeitos humanos. Como campo, administração de saúde é responsável por garantir que pacientes sejam recrutados para estudos de pesquisa de forma voluntária, na qual não tenham sido submetidos a pressão, engano ou falta de escolha. Pesquisa médica sofre de legado sombrio de coerção. No entanto, o Relatório Belmont de 1979 criou estrutura legal e prática para ética em pesquisa relacionada à saúde. Práticas de administração de saúde hoje desempenham papel vital em manter padrões éticos em pesquisa que oferece benefícios justos a investigadores e sujeitos.
De preocupações com seguros a custos de saúde crescentes, considerações econômicas ocupam grande lugar em administração de saúde e ética. Administradores de saúde frequentemente têm que manter equilíbrio delicado entre atender ao bem-estar financeiro de uma instituição e condições econômicas da população de pacientes. Um dos principais desafios éticos enfrentados por administradores é desenhar infraestrutura de saúde que imponha mínimo de limitações ao cuidado baseadas em custo e acesso.