Os produtos finais da digestão de proteínas são aminoácidos. As proteínas são moléculas grandes compostas por cadeias de aminoácidos. Durante a digestão, enzimas chamadas proteases quebram proteínas em peptídeos menores, que são posteriormente quebrados em aminoácidos individuais por peptidases. Os aminoácidos são então absorvidos na corrente sanguínea e usados para construir novas proteínas ou para outros processos metabólicos.