Agulhas hipodérmicas mal esterilizadas carregam risco significativo de infecção por microrganismos bacterianos, fúngicos ou virais. Diferente de desinfecção, que reduz microrganismos a níveis seguros, esterilização destrói todos, inclusive esporos bacterianos. Procedimentos são usados industrialmente e em hospitais, geralmente não apropriados para uso doméstico.
Método industrial comum: embalar a vácuo e expor à radiação. O vácuo fornece barreira física à recontaminação. Como pode danificar materiais, normalmente apropriado apenas para esterilização inicial de equipamentos médicos.
Método mais comum: expor agulhas ou equipamentos cirúrgicos ao calor. Calor seco ocasionalmente usado, mas pode ser longo e marginalmente eficaz. Calor úmido fornece resultados mais rápidos e consistentes.
Esterilização a calor úmido é frequentemente realizada em autoclave, que usa vapor pressurizado. Segundo Dr. R. Skilton do Bristol Royal Infirmary, autoclavação é o método mais prático para esterilizar agulhas.
Expor agulhas a produtos químicos esterilizantes é outra forma de matar células bacterianas e fúngicas. Óxido de etileno é gás incolor, tóxico e agente químico mais comum. Vantagem: eficaz contra todos microrganismos e sem risco de dano à agulha, mas pode levar até um dia e é relativamente caro. Formaldeído, glutaraldeído e ácido peracético são outros agentes comuns.