"Vírus estomacais" são bactérias, parasitas e vírus que causam inflamação do trato gastrointestinal. Essa condição é conhecida como gastroenterite. Um trato gastrointestinal inflamado interfere na capacidade do corpo de absorver e processar alimentos corretamente. Embora esses agentes sejam tipicamente não letais, podem ser fatais para crianças, idosos e pessoas com sistemas imunológicos comprometidos. O maior perigo da gastroenterite é a desidratação.
Rotavírus, calicivírus, adenovírus e astrovírus causam a maioria das infecções virais. Rotavírus são a principal causa de infecções por gastroenterite em crianças, segundo o Instituto Nacional de Diabetes e Doenças Digestivas e Renais. Sintomas envolvem vômito, febre, dor abdominal e diarreia. Calicivírus, como norovírus, infectam principalmente adultos. Surtos de norovírus geralmente ocorrem entre abril e outubro, com sintomas incluindo náusea, vômito, diarreia, fadiga, dor de cabeça e dores musculares. Adenovírus infectam principalmente crianças menores de 2 anos e podem causar vômito e diarreia. Astrovírus infectam principalmente crianças pequenas, mas também adultos. Os sintomas incluem vômito e diarreia, mas são mais brandos que norovírus e rotavírus.
Campylobacter jejuni, E. coli, salmonela, shigela, estafilococo e yersínia causam a maioria das infecções bacterianas. Infecções bacterianas são geralmente transmitidas através de alimentos contaminados. Essas bactérias tendem a contaminar alimentos durante o preparo por alguém que tem a bactéria nas mãos ou que entra em contato com ela em uma superfície contaminada. As bactérias também podem se desenvolver em alimentos como laticínios armazenados em temperaturas inadequadas. Vegetais às vezes são contaminados ao entrar em contato com água contendo traços de resíduos humanos ou animais. Essas infecções causam cólicas abdominais, fezes com sangue, náusea e vômito.
Alguns tipos de infecções parasitárias incluem E. vermicularis, G. lamblia, A. duodenale, N. americanus e E. histolytica. O parasita E. vermicularis também é conhecido como lombriga e geralmente infecta seu hospedeiro através de alimentos contaminados. O parasita vive no intestino grosso e causa coceira na região anal. O parasita G. lamblia é geralmente transmitido pela água e causa náusea, vômito e diarreia. A. duodenale e N. americanus são conhecidos como ancilostomídeos. O ancilostomídeo vive no solo e infecta seu hospedeiro através do contato com pele e cabelo. Causa sintomas típicos de gastroenterite como vômito e diarreia. E. histolytica é encontrado em resíduos humanos e transmitido através de alimentos contaminados. Este parasita causa dor abdominal intensa, fezes com sangue e febre.
Embora muitos dos parasitas, bactérias e vírus que causam gastroenterite não tenham vacinas ou curas, medidas preventivas existem para evitar contraí-los ou transmiti-los. Lavar bem as mãos após usar o banheiro, antes de preparar alimentos, após cavar no jardim ou solo e após trocar fraldas reduz muito o risco de contrair ou espalhar esses agentes. Higienizadores de mãos à base de álcool também são eficazes contra a maioria desses "vírus estomacais". Lavar vegetais antes de prepará-los e evitar frutos do mar crus também são formas de prevenir a contaminação.