Como membro da família das ranunculáceas (buttercup), cimicífuga pode causar alergias em quem é alérgico a essas plantas. Além disso, por conter ácido salicílico, alérgicos à aspirina podem não tolerar cimicífuga.
Como a raiz pode baixar pressão, pessoas com pressão baixa ou em tratamento para hipertensão devem ter cautela.
Segundo a Mayo Clinic, pesquisadores não determinaram por que cimicífuga alivia sintomas menopáusicos, mas especulam envolvimento hormonal. Mulheres com histórico de câncer de mama e doenças hormonais só devem usar sob supervisão médica.
Alguns países (Austrália, Reino Unido) adicionaram alerta em produtos de cimicífuga sobre risco raro de dano hepático.
Cimicífuga foi usada historicamente tanto para prevenir aborto quanto para induzir parto, então grávidas não devem tomar esta erva.