Estudo de 2008 com 1.700 pacientes na Finlândia e Austrália sugere que, em mulheres, o gene que predispõe o cérebro a enxaquecas está no cromossomo 10q23. Isso reforçou estudo americano anterior de 2002 na UCLA.
O livro "Enxaquecas Para Leigos" afirma que enxaquecas hemiplégicas familiares (com problemas extremos de coordenação em um lado do corpo) podem ser causadas por variante no cromossomo 19.
Embora desconheça-se como essas variações cromossômicas afetam o cérebro, a Mayo Clinic teoriza que torna o cérebro incapaz de absorver adequadamente o neurotransmissor serotonina.
Mulheres são três vezes mais propensas a enxaquecas que homens — independentemente dos genes masculinos, segundo estudos em gêmeos, publicados no Journal of Head and Face Pain em 2005.
Embora pessoas da mesma família possam compartilhar genes para enxaquecas, podem não compartilhar gatilhos. Gatilhos são alimentos, eventos, intolerância a medicamentos, mudanças hormonais ou climáticas que desencadeiam enxaqueca em um indivíduo.