Segundo a Avert.org, os efeitos colaterais mais frequentes no tratamento antirretroviral para HIV são diarreia, náusea, vômito, erupção cutânea e lipodistrofia (redistribuição de gordura corporal).
Como classe, os NRTIs causam efeitos como acidose láctica (acúmulo de ácido láctico no sangue), esteatose hepática e lipodistrofia. O abacavir (um NRTI) pode causar reação de hipersensibilidade grave.
Os NNRTIs estão associados a erupção cutânea e a duas condições graves: síndrome de Stevens-Johnson e necrólise epidérmica tóxica, que causam morte e perda de pele. Também podem ter interações sérias com outros medicamentos.
Os IPs causam principalmente efeitos metabólicos: aumento de gordura no sangue, hiperglicemia, resistência à insulina e lipodistrofia. Podem aumentar sangramento em hemofílicos e também interagem com outros fármacos.
Existem mais três classes, cada uma com um único fármaco: o inibidor de fusão enfuvirtida (reação no local da injeção, diminuição de leucócitos, pneumonia); o antagonista do co-receptor quimiocina maraviroc (diarreia, náusea, hepatite, infecções respiratórias, fadiga, tontura, dores); e o inibidor de integrase raltegravir (distúrbios digestivos, alteração hepática, cefaleia, mialgia, tontura, sonhos estranhos, erupção, fadiga).
É fundamental informar ao médico sobre quaisquer efeitos colaterais. O esquema terapêutico pode ser ajustado se forem graves, mas a alteração deve ser feita apenas sob orientação médica.