A proteína não é absorvida pelo intestino grosso. A maioria da digestão e absorção de proteína acontece no intestino delgado.
Estruturas especializadas (vili, microvilos) aumentam a superfície. Enzimas quebram proteínas em peptídeos e aminoácidos, que são absorvidos através dos vili para a corrente sanguínea.
O intestino grosso absorve principalmente água, eletrólitos e forma/armazena fezes; não desempenha papel significativo na absorção de proteína.