Denzin e Lincoln descrevem pesquisa qualitativa como "estudo das coisas em seus cenários naturais, tentando dar sentido ou interpretar fenômenos em termos dos significados que as pessoas lhes trazem". Métodos quantitativos focam na recolha e análise de dados numéricos. Pesquisadores aplicam cada vez mais métodos qualitativos a temas de saúde tão variados como planeamento familiar, doenças tropicais, cuidados paliativos e satisfação profissional de farmacêuticos. Estes métodos são especialmente usados em saúde pública e desenvolvimento internacional.
Entre as muitas razões para selecionar métodos qualitativos, Padgett nomeia as mais comuns: "explorar tema sobre o qual pouco se sabe", "prosseguir tema de profundidade e sensibilidade emocional", desejar "capturar a 'experiência vivida' na perspetiva de quem a vive" e avaliar programas — especialmente identificar barreiras à implementação e avaliar eficácia.
Às vezes observação consiste simplesmente em notar comportamentos das pessoas no seu cenário natural (não hospital), com poucas ou nenhumas interações diretas e sem muito conhecimento prévio. Noutras vezes, o investigador faz observação participante — originada no trabalho de campo etnográfico de antropólogos. O observador participante tanto participa como observa a comunidade de estudo nos seus próprios contextos, tentando como "forasteiro" entender o que significa ser "insider".
Técnicas qualitativas incluem entrevistas semiestruturadas, em profundidade, com informantes-chave e grupos focais. Com semiestruturada, o mesmo conjunto de perguntas abertas é dado a amostra de participantes. Entrevistas em profundidade "desenhadas para elicitar quadro vívido da perspetiva do participante sobre o tema". Entrevistados com especialização além das próprias experiências são "informantes-chave". Grupos focais, convocados por investigadores para discutir tema, produzem insights qualitativos sobre dinâmicas de grupo.
Análise de conteúdo determina que palavras ou conceitos existem num documento ou conjunto e avalia suas inter-relações. Embora às vezes conduzida quantitativamente, investigadores de saúde aplicam rotineiramente a dados recolhidos por observações e entrevistas qualitativas — transcrições de áudio, vídeo ou notas de campo. Análise qualitativa de conteúdo também pode ser aplicada produtivamente a documentos não criados para o projeto, como ficheiros de histórico clínico e materiais de educação em saúde pública.
Metodologia mista é simplesmente o uso de métodos qualitativos e quantitativos no mesmo estudo. Frequentemente produz achados mais completos e ricos que qualquer método isolado.