Hormônios bioidênticos têm a mesma estrutura química dos hormônios naturalmente produzidos pelo corpo.
Precursores de estrogênio e progesterona bioidênticos são derivados de soja ou raiz de inhame selvagem mexicano (Dioscorea villosa).
Compostos bioidênticos administrados na terapia são diferentes dos originalmente extraídos das plantas. Plantas não fabricam hormônios bioidênticos prontos. Químicos naturalmente encontrados nas plantas são beta-sitosterol e diosgenina, que não são o que o corpo feminino produz. Estas substâncias são sintetizadas em 17 beta-estradiol, estrona, estriol e progesterona bioidênticos.
Hormônios bioidênticos vêm como: preparações padronizadas aprovadas pelo FDA, ou preparações manipuladas customizadas para cada indivíduo. Versão customizada não é aprovada pelo FDA mas não necessariamente de qualidade/eficácia inferior.
O debate sobre superioridade alegada dos hormônios bioidênticos é acalorado. Médicos respeitados, incluindo Dr. John Lee (pioneiro), Dra. Erika Schwartz (proponente principal), Dr. Kent Holtorf (especialista), entre muitos, veementemente alegam que bioidênticos manipulados são melhor tolerados e oferecem perfil de segurança melhor que hormônios convencionais. Por outro lado, organizações altamente respeitáveis — Congresso Americano de Obstetras e Ginecologistas, Sociedade Norte-Americana de Menopausa, Harvard Medical School — rejeitaram estas afirmações, citando falta de evidência suficiente. Status pode mudar com mais dados.