Cefaleia matinal crónica é diagnosticada quando acontece pelo menos 15 manhãs num mês. Segundo o estudo marcante "Prevalência e Fatores de Risco de Cefaleias Matinais na População Geral" do Dr. Maurice M. Ohayon, publicado nos Archives of Internal Medicine a 12 jan 2004, uma em 13 pessoas sofre de cefaleia matinal crónica.
Segundo o estudo de Ohayon, ser mulher aumenta a chance de cefaleias matinais crónicas, mas a razão é incerta, embora mulheres tenham enxaquecas três vezes mais que homens.
Costumava pensar-se que a maioria das cefaleias matinais crónicas eram causadas por problemas de sono ou ranger os dentes durante o sono. O estudo de Ohayon refutou isso, mas problemas de sono ou bruxismo ainda podem ser causa.
Pessoas com depressão clínica ou congestão sinusal também têm cefaleia matinal crónica. Nestes casos, as dores de cabeça não desaparecem até a condição primária ser tratada.
Segundo a MAGNUM, Associação Nacional de Enxaqueca, dependência de drogas como cafeína, analgésicos ou opiáceos pode causar cefaleias matinais previsíveis nas primeiras horas da manhã.
Segundo o estudo de Ohayon, pessoas desempregadas sofrem mais de cefaleia matinal crónica que aquelas com emprego.