Embora raro, o café pode ser fonte de doenças transmitidas por alimentos. Grãos crus, processamento inadequado e aditivos (leite, cremes) são pontos críticos.
O café cresce em climas tropicais úmidos, propícios a fungos. A Aspergillus produz aflatoxina (hepatotóxica, cancerígena) e ocratoxina (neurotóxica, nefrotóxica). A ocratoxina não é destruída pelo cozimento e tem alta letalidade.
Secagem inadequada após a colheita aumenta o risco. Contaminação de baixo nível é comum, mas geralmente abaixo dos limites legais.
Leite cru ou mal pasteurizado, cremes contaminados e manipulação inadequada (temperatura ambiente > 2h) permitem proliferação de Salmonella, Listeria, E. coli, causando gastroenterite, listeriose, salmonelose.
O café em si não é um alimento de alto risco, mas a cadeia de produção, armazenamento e preparo pode introduzir perigos. Higiene rigorosa e controle de temperatura são essenciais.