O governo federal oferece alguns empréstimos diretos a comunidades para construir ou melhorar sistemas de esgoto. Por exemplo, o Serviço de Utilidades Rurais do Departamento de Agricultura oferece subsídios a comunidades com menos de 10.000 residentes para trabalhar em utilidades de água, incluindo águas residuais. Outros programas incluem o Programa Colonias da EPA para comunidades pobres ao longo da fronteira mexicana e o Programa de Construção de Instalações de Saneamento do Serviço de Saúde Indígena do Departamento de Saúde e Serviços Humanos, que fornece serviços técnicos a comunidades nativo-americanas.
O Departamento de Habitação e Desenvolvimento Urbano opera o programa de Subsídio em Bloco para Desenvolvimento Comunitário (CDBG). O HUD apropria dinheiro para estados, que depois distribuem subsídios. Comunidades podem candidatar-se a fundos CDBG através da agência estadual apropriada para muitos projetos, incluindo projetos de esgoto. Adicionalmente, o Departamento de Comércio apropria dinheiro à Comissão Regional dos Apalaches para uso por comunidades na região para completar projetos de desenvolvimento económico, como construção e expansão de estações de tratamento de esgoto.
Finalmente, a EPA oferece o Fundo de Empréstimo Rotativo Estadual de Água Limpa. A EPA apropria dinheiro para estados estabelecerem empréstimos de juro baixo a municípios para realizar projetos de tratamento de esgoto. À medida que as comunidades reembolsam o dinheiro, os estados podem emprestar o dinheiro a outras comunidades. A EPA também oferece um Programa de Subsídios de Dificuldade a comunidades com menos de 3.000 pessoas para compensar alguns dos custos de programas de empréstimo rotativo.