Estômago e intestinos abrigam bilhões de bactérias benéficas. Mantêm o pH gástrico equilibrado, auxiliam na digestão e liberam vitaminas B e K dos alimentos. A flora intestinal impede que bactérias patogênicas se instalem e contribui para o desenvolvimento muscular intestinal.
Muitas bactérias fermentam laticínios. Enquanto algumas estragam alimentos, outras criam produtos que consumimos: Streptococcus diacetilactis produz creme de leite azedo e manteiga; Propionibacterium shermanii dá sabor e buracos ao queijo suíço. Outras espécies criam cottage cheese, iogurte, cheddar — cada uma gerando variedade alimentar.
Nosso corpo é coberto por bactérias; não adianta lavar excessivamente, elas pertencem lá. Temos relação simbiótica (comensalismo): elas ganham abrigo, calor e alimento; em troca, impedem bactérias patogênicas de nos adoecer. A microflora que nos protege é chamada de comensais.
Quando infectados por bactérias patogênicas, nosso sistema imune reage. Com o tempo, desenvolvemos imunidade individual. No século XX, antibióticos combateram bactérias ruins, mas estas evoluíram resistência. Estudos mostram que probióticos (bactérias boas ingeridas via alimentos) podem combater patógenos resistentes a antibióticos.