O oxigênio medicinal deve ter pureza mínima de 99% (apenas 1% de outros gases). Oxigênio usado em instalações médicas ou por pacientes em casa deve atender aos requisitos da U.S. Pharmacopeia (USP), grupo não governamental que define padrões nos EUA. Se não atender, não pode ser administrado a pacientes.
O enchimento segue procedimento específico: o operador cheira o cilindro antes de enchê-lo, verificando odor de acetileno. Cheiro de acetileno indica que o cilindro não está purificado; oxigênio adicionado não atenderia padrões médicos. Sem cheiro, o cilindro é usado para oxigênio medicinal; com cheiro, destinado a uso industrial.
Oxigênio medicinal não pode ter odor. Segundo a CFC, oxigênio é naturalmente inodoro. Odor indica presença de outro gás misturado, tornando-o impróprio para uso médico.