A fluorescência é usada como método de detecção em muitas técnicas de caracterização molecular químicas e biológicas.
A fluorescência ocorre quando luz de certo comprimento de onda (frequentemente ultravioleta) incide sobre material que absorve essa luz e emite luz em comprimento de onda maior (mais longo). Frequentemente essa emissão é luz visível, fazendo o material parecer brilhar.
Algumas moléculas são naturalmente fluorescentes e podem ser estudadas por fluorescência direta. Fatores como proximidade a outras moléculas e interações com solvente alteram as propriedades fluorescentes. Essas mudanças fornecem informações sobre interações moleculares, agregação e auto-montagem.
Anticorpos fluorescentes revelam certas estruturas celulares. Pode identificar tipos celulares, visualizar organelas específicas, medir metabolismo celular, entre outros usos.
Embora o DNA seja fracamente fluorescente, muitas técnicas de biologia molecular dependem de complexos fluorescentes de DNA para quantificação, sequenciamento e rastreamento.
A lista de métodos de detecção por fluorescência é longa e variada. Proteínas podem ser engenheiradas para conter domínios fluorescentes, permitindo rastreamento dentro de células e organismos. Fluorescência pode ser usada em cromatografia para separar molécula de interesse de mistura e em biofísica para determinar taxa de mudança conformacional de molécula única.