As bactérias empregam defesas multicamadas sofisticadas contra bacteriófagos (fagos):
Imunidade inata. Endonucleases de restrição reconhecem e clivam sequências de DNA de fago não metiladas. O DNA do hospedeiro é protegido por metilação nos mesmos sítios. >3.000 sistemas RM conhecidos.
Imunidade adaptativa. As bactérias integram fragmentos curtos de DNA de fago (espaçadores) em arranjos CRISPR. Na reinfecção, RNAs CRISPR guiam nucleases Cas para atacar e destruir o DNA de fago correspondente. Fornece memória específica de sequência.
Suicídio altruísta. A célula infectada detecta componentes de fago e desencadeia morte prematura (parada metabólica, despolarização de membrana, ativação de toxina-antitoxina). Impede a replicação do fago e a disseminação para irmãos clonais.
Essa corrida armamentista evolutiva impulsiona imensa diversidade tanto na ofensiva dos fagos quanto na defesa bacteriana.