À medida que madeira apodrece, rachaduras e buracos se desenvolvem. Insetos e pequenos animais entram do ambiente externo para área de processamento de alimentos. Contaminação ocorre através de fezes de animais, insetos em muda e espécimes famintos que entram nos silos de alimentos.
Madeira apodrecendo frequentemente indica infestação de mofo e bolor. Isso pode causar esporos aerotransportados que infectam a área de processamento. Certos tipos de mofo não tratados são fatais a humanos. Contaminação de alimentos por mofos causa doenças e condições graves de saúde em massa quando produto infectado chega a consumidores.
Vigas são necessidades estruturais para enquadrar edifício. Quando vigas de madeira de área de processamento começam a apodrecer, integridade estrutural é comprometida. Telhado perde suporte ou paredes cedem quando vigas enfraquecem pelo apodrecimento.