Lagoas são pequenos corpos de água parada que podem ser naturais ou artificiais. Muitos corpos d'água artificiais são classificados como lagoas, incluindo lagoas de carpas, jardins aquáticos, viveiros comerciais e lagoas solares. Outro tipo é a lagoa de fazenda, criada para fornecer água ao gado.
Ecossistema é termo usado para descrever a complexa relação entre animais, plantas e microrganismos em um ambiente e seu ambiente não vivo. O estudo de um ecossistema busca aprender sobre os organismos e sua interação com o ambiente. Organismos são divididos em produtores, consumidores e decompositores. Produtores fornecem alimento para consumidores e, eventualmente, para decompositores. Todos estão interligados; uma lagoa não é exceção.
Os produtores primários em uma lagoa são as plantas. Usam energia solar para converter CO₂ e água em compostos orgânicos via fotossíntese. Plantas em lagoas incluem fitoplâncton, algas perifíticas, plantas submersas e flutuantes. Fitoplâncton são algas microscópicas que flutuam na superfície, muitas vezes dando aspecto esverdeado. São a principal fonte de oxigênio dissolvido. Algas perifíticas são minúsculas algas que se fixam em rochas e materiais submersos, dando aspecto esverdeado e viscoso. Plantas submersas crescem completamente debaixo d'água; flutuantes ficam na superfície. Plantas emergentes crescem em águas rasas com caules e folhas acima da superfície. Outros produtores incluem plantas de margem que crescem no solo úmido na borda, como lírios d'água e jacintos d'água.
Consumidores no ecossistema de lagoa dividem-se em zooplâncton, invertebrados e vertebrados. Zooplânctons são animais microscópicos invisíveis sem microscópio. Vertebrados são animais maiores com coluna vertebral; invertebrados não têm coluna. Exemplos: peixes, patos, cobras, caramujos e sapos.
Animais mortos, plantas e resíduos acumulam-se no fundo. Decompositores decompõem esse material em forma que produtores primários possam usar. São principalmente micróbios como bactérias. Desempenham papel no ecossistema liberando monóxido de carbono ao decompor material em decomposição, que as plantas utilizam. Assim, mantêm o ciclo ativo.