Nem todos os planos de benefícios em grupo oferecem HSAs. Existe uma categoria específica de seguro de saúde em grupo que os empregadores podem oferecer e que permitem HSAs, conhecidos como planos compatíveis com HSA. Esses planos têm características específicas que tendem a oferecer cobertura ligeiramente menor que outras opções. Por exemplo, muitos desses planos têm franquias mais altas que outras opções de seguro. Eles também são obrigados a ter benefícios preventivos incluídos no pacote. Esses benefícios preventivos incentivam os funcionários a comer bem e se exercitar para se manterem saudáveis.
As HSAs também têm problemas de compatibilidade quando se trata de outros tipos de contas de poupança. Aqui, os detalhes diferem com base nas apólices e leis estaduais. Se o titular da apólice já é coberto por outra HSA ou uma conta de gastos flexíveis (FSA) através de outra apólice, provavelmente não se qualificará para uma HSA. Por exemplo, um cônjuge com uma FSA pode não conseguir usar fundos da HSA do titular. Múltiplas contas de poupança livres de impostos são desencorajadas por políticas e legislação.
As HSAs também são limitadas com base nas despesas com as quais são compatíveis. Cada apólice tem uma lista de despesas qualificadas que os fundos podem ser usados para pagar, mas também existem despesas que as HSAs não podem cobrir. Despesas qualificadas são tipicamente custos associados a cuidados médicos necessários e não apenas qualquer tipo de procedimento ou tratamento. Quando os fundos são usados para pagar despesas não qualificadas, o dinheiro é tributado como se fosse renda normal.
Os benefícios fiscais que as HSAs oferecem podem economizar dinheiro aos usuários todos os anos que, de outra forma, teriam que pagar em impostos de renda, desde que usem os fundos da HSA durante aquele ano. Contas HSA também tendem a ter taxas que podem render juros. Os planos compatíveis com HSA, embora tenham franquias mais altas, também têm prêmios mais baixos e incentivam estilos de vida saudáveis.