Thuja foi primeiro usado como medicamento homeopático por colonos ingleses e nativos americanos, que usavam extratos da árvore para tratar gota, tosse, malária e reumatismo.
Thuja homeopático usado mais comumente para condições físicas: problemas respiratórios, menstruais, genitais externos, verrugas, asma, dores de cabeça. Também para depressão, pesadelos, insônia e irritabilidade.
Dependendo da condição, thuja pode ser administrado como pílula, creme ou líquido.
Quando usado como homeopático, thuja é diluído em água e pode perder substância ativa necessária para valor terapêutico.
Grandes quantidades de óleo de thuja não diluído podem ser venenosas e causar efeitos colaterais graves se ingerido internamente, incluindo morte.