Minamata é uma cidade pesqueira japonesa que abrigava uma fábrica química da Corporação Chisso. A fábrica abriu em 1908 e começou a despejar água residual no Rio Minamata no início dos anos 1930. Em 1956, os moradores notaram comportamento animal estranho — gatos "dançando" na rua, depois caindo mortos. No mesmo ano, moradores humanos também começaram a exibir sintomas preocupantes. Médicos logo perceberam que os moradores sofriam de envenenamento severo por mercúrio — resultado de água e peixes contaminados da baía. Nos anos 1960, outro surto ocorreu na Prefeitura de Niigata às margens do Rio Agano. A doença de Minamata é considerada uma das Quatro Grandes Doenças de Poluição do Japão.
O primeiro caso humano documentado foi uma menina de 5 anos que teve dificuldade para andar e falar, e depois convulsões. Sua irmã apresentava os mesmos sintomas e, finalmente, outros oito casos iniciais foram descobertos entre amigos e vizinhos. Com o tempo, ficou aparente que a doença era generalizada pela cidade. Alguns pacientes experimentaram tremores musculares, perda de visão e audição, e dificuldade para controlar movimentos oculares. Outros tiveram dormência nas mãos e pés ou fala arrastada. Alguns apresentaram apenas sintomas leves como dores de cabeça, fadiga e perda de paladar e olfato. O envenenamento por mercúrio é frequentemente chamado de "Doença do Chapeleiro Louco", devido ao efeito da exposição prolongada ao mercúrio em fabricantes de chapéus antigos. Em casos graves, pacientes exibiram alucinações e delírios, agressão e outras formas de "loucura", bem como perda de consciência e até morte.
O mercúrio não apenas ataca o sistema nervoso, também afeta o desenvolvimento fetal. A doença não terminou com o surto inicial. Nos anos seguintes, Minamata experimentou um número anormalmente alto de crianças nascidas com paralisia cerebral, defeitos congênitos e problemas neurológicos. Até bebês de mulheres que não tinham sintomas visíveis de Minamata não eram imunes.
Nem todos os afetados exibiram sintomas de uma vez. Algumas pessoas tinham altos níveis de mercúrio em seus sistemas e permaneceram assintomáticas por anos, até décadas, então desenvolveram sintomas graves repentinamente. Também houve aqueles que experimentaram sintomas leves que pioraram progressivamente por um longo período. Em muitos casos, essas pessoas não foram consideradas vítimas de Minamata, porque seus sintomas não correspondiam aos critérios rígidos estabelecidos pelo governo japonês.