Os principais efeitos colaterais são sonolência, sedação e lentidão mental. Alguns relatam tontura, confusão leve e problemas de coordenação semelhantes aos do álcool (EMedTV). Cuidado ao dirigir ou operar máquinas. A flor-da-paixão potencializa efeitos de sedativos: anticonvulsivantes, barbitúricos, benzodiazepínicos, antidepressivos tricíclicos e indutores de sono.
Pode aumentar efeitos (benéficos e adversos) de antidepressivos inibidores da monoaminoxidase (IMAOs), que interagem com muitas substâncias. Quem toma isocarboxazida (Marplan), fenelzina (Nardil) ou tranilcipromina (Parnate) não deve usar flor-da-paixão.
Pode prolongar tempo de coagulação, aumentando risco de sangramento anormal. Pessoas com distúrbios hemorrágicos devem ter cautela. Quem usa anticoagulantes (aspirina, varfarina) ou Ginkgo biloba também deve ter cuidado ao combinar.
Relatos de reações alérgicas, erupções, asma, problemas sinusais e vasculite (NIH). Podem ser devidos a contaminação de produtos comerciais, não à planta em si. Suplementos herbais não são regulados como medicamentos; alguns contêm metais pesados, fármacos ou outras substâncias. Compre apenas de fabricantes confiáveis.