Neisseria meningitidis (meningococo) é um diplococo Gram-negativo. O padrão para coloração de Gram do LCR é um microscópio óptico composto com objetiva de imersão em óleo 100× (1000× de ampliação total). Microscopia de contraste de fase ou campo escuro pode visualizar motilidade ao vivo. Microscopia eletrônica revela pilos e ultrastructure da cápsula, mas não é de rotina. PCR e cultura permanecem os diagnósticos-padrão-ouro; a microscopia fornece identificação presuntiva rápida.