Introduzida nos anos 1930. Nos anos 60-70, desenvolveram-se a maioria das técnicas para separar ADN e proteínas.
A maioria de ADN, ARN e proteínas pode ser detetada, independentemente do tamanho. A concentração da matriz do gel é escolhida antecipadamente para separar facilmente a molécula de interesse pelo tamanho estimado.
Não precisa de grande quantidade de material inicial. Exemplo: picogramas de ADN detetáveis por eletroforese.
Após corrida no gel, é possível extrair amostra para análise posterior. Porém, é quase impossível recuperar todo o material da amostra original.
Cuidado ao manusear materiais. Exemplo: brometo de etídio, comum em eletroforese de ADN, é mutagénico conhecido.