Células estaminais embrionárias possuem maior capacidade de transformação, desenvolvendo-se em todas as células necessárias para organismo saudável. Células estaminais adultas, na medula óssea e células somáticas (corpo), quimica e geneticamente estimuladas a tornarem-se estaminais, também têm potencial de transformação. Questões éticas em torno da transformação celular humana envolvem principalmente definição de vida humana e direito dos cientistas de desmantelar ou alterar essa vida pelo bem maior.
Em setembro 1999, a Comissão Nacional Consultiva de Bioética (NBAC) emitiu "Questões Éticas em Pesquisa com Células Estaminais Humanas", cobrindo pesquisa atual e questões éticas no uso de linhas de células estaminais embrionárias e somáticas/adultas. O veredito final levou o governo dos EUA a suspender financiamento para pesquisa embrionária. Em vez disso, incentivou uso de linhas existentes e pesquisa contínua com células adultas. Em 2009, a proibição de financiamento federal para pesquisa embrionária foi levantada, desde que laboratórios cumpram diretrizes dos Institutos Nacionais de Saúde.
Maioria da pesquisa usa embriões congelados descartados, originalmente para fertilização in vitro. Inicialmente e em algumas instalações privadas, pesquisadores geram linhas embrionárias por fertilização in vitro de óvulo doador apenas para pesquisa. Para usar células estaminais, separam blastocistos (embrião primitivo) em células individuais, removendo capacidade de desenvolvimento. Muitos veem isto como aborto preventivo e criação de humanos estritamente para pesquisa. Como definição de "direito à vida" é área cinzenta filosófica e científica, NBAC optou por remover/limitar financiamento a técnica que muitos acham ofensiva.
Devido à suspensão de financiamento federal para pesquisa embrionária, cientistas focaram em transferência nuclear. Transferindo núcleo de célula adulta para óvulo doador anucleado, criaram novas linhas estaminais com correspondência genética exata para pacientes. Tratando quimicamente as novas linhas, cientista pode estimular transformação direcionada — formar apenas células de pele ou músculo cardíaco. Eticamente, abre portas à clonagem humana e crianças "desenhadas". Cientistas poderiam engenhar geneticamente célula única, implantá-la em embrião doador para criar filho "perfeito".
Até que ciência, filosofia e/ou órgão governamental definam claramente quando a vida e o direito à vida começam, o debate sobre preocupações éticas da pesquisa com células estaminais embrionárias e informação ganha continuará indefinidamente.