Muitas causas levam animais, plantas e insetos à lista de espécies ameaçadas. Milhares de mamíferos, répteis, aves e outros seres vivos correm risco de extinção devido a mudanças ambientais, doenças e ação humana. É tarde para salvar os já extintos, mas muitos podem ser ajudados reduzindo esses fatores negativos.
O aquecimento global eleva temperaturas e causa mudanças climáticas severas. O derretimento das calotas polares devasta o habitat natural de animais como ursos polares, golfinhos e focas. Muitas criaturas marinhas, como salmões e outros peixes, são sensíveis à temperatura da água. Corais respondem ao aumento de temperatura liberando suas próprias algas no oceano, o que frequentemente causa a morte dos recifes. A elevação do nível do mar leva a inundações que impactam mamíferos terrestres. O aumento de secas pode eliminar fontes de alimento. A pika, pequena espécie de coelho nativa dos EUA, não se adapta ao aumento de temperatura e já abandonou um terço de seu habitat anterior em busca de temperaturas mais frias.
Baleeiros, caçadores furtivos e caçadores causaram declínio populacional de animais como baleias-jubarte, chimpanzés, gorilas, leopardos-das-neves e pandas-gigantes. Embora leis protejam muitos animais, continuam ameaçados de morte por seus ossos, pele e pele ou comércio ilegal como animais de estimação. Às vezes, humanos introduzem espécies não nativas, causando desequilíbrios no ecossistema, como ocorre com onças-pintadas. Alguns animais tornam-se vulneráveis a esses novos predadores. Isso também cria maior competição por fontes de alimento.
O desmatamento causou perda de habitat a muitas espécies. Pode ser causado por extração de madeira, mineração e causas naturais como incêndios florestais. Espécies nativas de selvas e florestas tropicais, como orangotangos e tigres, são ameaçadas pela perda de habitat. Preguiças-de-coleira e lóris-esbelto estão ameaçados exclusivamente pelo desmatamento. Elefantes-asiáticos, ariranhas e zebras-das-montanhas são todos ameaçados pela perda de habitat.
Raiva na África Oriental mata lobos-etíopes enquanto muitas aves são dizimadas pela malária aviária. Coalas são ameaçados pela propagação de clamídia e AIDS. Animais domésticos também transmitem doenças a selvagens. Poluição por chuva ácida, derramamentos de óleo e descarte de químicos tóxicos na água afeta muitas espécies de sapos, aves e peixes. Estes animais, especialmente sapos, também estão ameaçados pelo uso de pesticidas e fertilizantes que enfraquecem seus sistemas imunológicos e matam seus ovos.