Colheita por dragagem é processo para coletar amêijoas, ostras, crustáceos e outros organismos bentônicos do fundo de rios, riachos e oceanos. Na dragagem, pescadores arrastam redes grandes e pesadas ao longo do fundo de corpo d'água para capturar mariscos. Infelizmente, técnica de dragagem pode causar problemas ao ecossistema marinho, causando danos de curto e longo prazo.
À medida que enormes redes passam sobre fundo do oceano ou rio, frequentemente capturam muitas espécies não alvo — esta captura não intencional é conhecida como bycatch. Estes organismos tendem a ter pouco ou nenhum valor comercial, e frequentemente morrem quando pescadores os devolvem à água. Em rios frequentemente dragados, isso pode levar a depleção parcial ou total de uma espécie. Quando ocorre com uma ou mais espécies, biodiversidade de toda região sofre.
Embora redes de dragagem não recolham todas plantas bentônicas, ato de dragagem ainda pode danificar ou matar muitas plantas aquáticas. Sem estas plantas filtrando água e fazendo fotossíntese, qualidade da água pode diminuir rapidamente. Taxa reduzida de fotossíntese pode causar concentração diminuída de oxigênio dissolvido na água, tornando habitat inadequado para certos organismos. Isso também pode causar perda de biodiversidade na área.
Um elemento chave de muitos ecossistemas aquáticos é a rugosidade do habitat. Rugosidade é complexidade do fundo do rio ou mar; superfície mais complexa permite mais nichos para vários organismos. Quando dragagem ocorre, fundo do mar é frequentemente raspado limpo, removendo rochas, plantas, troncos e outros objetos que poderiam prover habitat para criaturas marinhas. Sem aquele labirinto de abrigos para proteção de predadores e marés fortes, muitas espécies não sobrevivem.
Sempre que algo é arrastado ao longo do fundo marinho coberto de sedimentos, causa sujeira, areia e lodo a ficarem suspensos na água. Isso faz água parecer marrom e turva. Dragagem pode causar turbidez temporária, que pode desorientar muitos organismos marinhos e causar dificuldade para absorver oxigênio. Turbidez também pode levar a redução de infiltração de luz na água, diminuindo atividade fotossintética de plantas folhosas ou fitoplâncton, causando menores concentrações de oxigênio dissolvido.