Organismos evoluíram e desenvolveram mecanismos que lhes permitem viver em seu ecossistema. Ecossistema marinho e de água doce são ambos ecossistemas aquáticos. A principal diferença é o nível de salinidade no ecossistema marinho comparado ao de água doce. Profundidade e escopo do ecossistema marinho também são muito mais amplos. Organismos vivendo nestes ecossistemas aquáticos adaptaram-se para sobreviver em seu ambiente.
A maioria dos animais marinhos adaptou-se para sobreviver debaixo d'água por períodos prolongados. Nível de pressão em corpos d'água enormes como oceanos e mares é enorme. Segundo Marinebio.org, pressão aumenta 1,03 kg/cm² a cada 10 metros de água. A maioria dos organismos de água doce não sobrevive nas profundidades que organismos marinhos conseguem. Alguns, como focas-elefante e focas-de-Weddell, desenvolveram adaptações permitindo mergulhar até 1,6 km de profundidade. Têm pulmões que podem colapsar assim que iniciam mergulho íngreme.
Mamíferos marinhos como focas, baleias e peixes-boi desenvolveram adaptações para sobreviver no ambiente marinho. Água pode ser extremamente fria, e estes mamíferos devem manter temperatura corporal acima da água. Uma adaptação é desenvolvimento de camada protetora de gordura conhecida como "blubber". Blubber serve como isolante entre mamíferos e água fria. Mamíferos de água doce não têm esta adaptação porque não é necessária. Por exemplo, lontras marinhas não têm muita gordura corporal. Dependem de pelagem espessa para se manterem quentes.
Plantas e animais marinhos evoluíram para sobreviver no ambiente marinho, apesar do alto teor de sal. A maioria dos organismos marinhos tem processos especializados para filtrar excesso de sal de seus sistemas. Têm rins e brânquias altamente adaptados que ajudam no processo de osmorregulação, que regula pressão osmótica nos fluidos internos. Esta regulação ajuda a combater excesso de diluição ou concentração de fluidos corporais. Mesmo processo vale para animais de água doce; usam osmorregulação para evitar que fluidos corporais fiquem muito diluídos por excesso de água. Organismos adaptados a alta salinidade incluem crocodilos. Diferente de jacarés de água doce, preferem corpos d'água salobros e salgados.
Plantas e animais vivendo em áreas marinhas com marés fortes, como estuários, adaptaram-se para viver em tais áreas. Organismos como berbigões têm conchas fortes para resistir ação de fluxo e refluxo da maré. Cirrípedes e mexilhões desenvolveram apêndices que lhes permitem agarrar-se a rochas, protegendo-os de serem levados para o mar. Mexilhões de água doce e marinhos têm características diferentes; mexilhões marinhos têm conchas mais fortes e apêndices filamentosos com os quais se fixam a rochas.