Em estudos clínicos pré-aprovação com 3TC, mais de 20% dos participantes experimentaram fadiga e mal-estar, dores de cabeça ou infecções de ouvido, nariz ou garganta.
Outros efeitos comuns incluem dor abdominal, diarreia, tontura, dor muscular ou articular, náusea, vômito, febre, calafrios e fraqueza.
O 3TC pode causar neuropatia periférica, com dano nervoso nos pés e mãos. Sintomas incluem sensação de queimação ou dormência.
Outro efeito colateral do 3TC é pancreatite, geralmente em crianças. Sintomas incluem dor abdominal, náusea e vômito, febre, taquicardia e taquipneia.
Efeito colateral raro mas muito sério associado ao 3TC é acidose láctica. É um distúrbio ácido-básico do fígado e sangue. Sinais incluem urina escura ou icterícia, fadiga óbvia, falta de ar, respiração rápida, dores musculares, náusea e vômito.