O TEA tem uma arquitetura genética complexa e heterogênea. As principais categorias de mutações incluem:
Mutações pontuais (senso errado, sem sentido, sítio de splicing) que alteram a sequência codificante de um único gene. Podem ser herdadas ou de novo.
Deleções/duplicações de grandes segmentos de DNA (≥1 kb), frequentemente abrangendo múltiplos genes. Fortemente associadas ao TEA (por exemplo, 16p11.2, 15q11-13).
Mutações espontâneas não presentes nos genomas parentais. Enriquecidas no TEA, especialmente em genes que regulam o desenvolvimento neuronal, função sináptica, remodelação da cromatina.
Translocações, inversões, aneuploidias. Exemplo: Síndrome do X Frágil (FMR1 expansão de CGG) — uma condição conhecida associada ao TEA.
Estudos de associação do genoma inteiro identificam numerosos SNPs comuns com efeitos individuais pequenos que contribuem coletivamente para o risco poligênico.
Mutações diversas frequentemente disrupam vias comuns: sinalização sináptica, regulação transcricional, excitabilidade neuronal. Essa convergência ajuda a explicar a variabilidade fenotípica.