Durante uma colonoscopia, o paciente deita do lado esquerdo com os joelhos puxados em direção ao peito (posição de decúbito lateral esquerdo). Essa posição facilita a passagem do endoscópio pelo cólon sigmóide e reduz o looping.
A sedação é tipicamente administrada para conforto. O procedimento não envolve deitar decúbito ventral (barriga para baixo) ou decúbito dorsal (costas para baixo) como posição primária.