Embora o tratamento seja eficaz e dure meses, segundo o New York Times, irritação pulmonar e ocular foi relatada durante a aplicação. Fumaças causam ardor em áreas sensíveis (garganta, nariz, olhos). Após o tratamento inicial, fumaças também podem ser liberadas na primeira secagem, modelagem ou alisamento.
Tratamentos brasileiros de queratina podem conter formaldeído, cancerígeno conhecido. Segundo a CBS News, fumos liberados na aplicação representam riscos para cliente, aplicador e pessoas próximas. Dermatologistas alertam que o químico pode se decompor mesmo após aplicado, aumentando perigo. Uma morte no Brasil foi ligada ao tratamento.
Embora não seja necessariamente risco à saúde, suplementos de queratina podem causar odor desagradável na aplicação, devido ao alto teor de enxofre. Ao aquecer ou queimar, cheiro forte de enxofre. Como tratamentos geralmente não requerem calor, esse efeito é raro.