O estireno, unidade estrutural básica do isopor, é conhecido por causar complicações gastrointestinais e irritação da pele, olhos e trato respiratório superior. A exposição prolongada ao isopor afeta o sistema nervoso central. Trabalhadores de indústrias que fabricam produtos à base de isopor relataram dores de cabeça, fadiga e depressão, sintomas de sistema nervoso prejudicado. O isopor também tem efeitos menores no funcionamento dos rins e do sistema vascular.
Mulheres que trabalham em indústrias que usam isopor apresentaram taxa acima do normal de abortos espontâneos. No entanto, devido à falta de dados adequados, a Agência de Proteção Ambiental dos EUA (EPA) não estabelece correlação conclusiva entre esses incidentes e a exposição ao isopor. Estudos em animais também não indicam que o isopor afete o desempenho reprodutivo dos organismos.
A Agência Internacional de Pesquisa em Câncer (IARC) na França classificou o estireno como possível carcinógeno para humanos. Estudos e observações com indivíduos que trabalham em fábricas que usam estireno indicam que esses indivíduos têm maior risco de leucemia e linfoma do que pessoas empregadas em outros setores. No entanto, a EPA não confirma efeitos carcinogênicos do estireno devido à presença de outros contaminantes químicos nos ambientes dos sujeitos estudados.
Hidrocarbonetos liberados durante a fabricação do isopor combinam-se com óxidos de nitrogênio na atmosfera e formam ozônio troposférico próximo à superfície da Terra. A exposição ao ozônio causa dor no peito, tosse, chiado e outros problemas respiratórios. Segundo a EPA, Califórnia, Costa do Golfo do Texas, área de Chicago-Milwaukee e nordeste dos EUA têm má qualidade do ar devido às altas quantidades de hidrocarbonetos liberados por fábricas que produzem bens de isopor.
O estireno entra no corpo humano através de alimentos guardados em copos e pratos de isopor. Maior teor de gordura e reaquecimento de alimentos em recipientes de isopor são dois fatores que aceleram a contaminação dos alimentos com estireno.
O isopor não é biodegradável. Embora exista tecnologia para reciclar isopor, a maioria das unidades de reciclagem se recusa a aceitar produtos de isopor devido aos altos custos envolvidos. No entanto, com os desenvolvimentos contínuos no campo de polímeros biodegradáveis, um substituto ecológico para o isopor parece estar no horizonte.