Muitos organismos têm ambientes adequados e inadequados. Para a bactéria Proteus mirabilis, o ambiente certo é o trato intestinal humano, onde ocorre naturalmente. Ela auxilia a digestão. O problema surge quando a bactéria sai do intestino e invade outros órgãos, causando múltiplas infecções. Fontes onde a bactéria é encontrada fora do trato humano são bem estudadas e documentadas por pesquisadores.
A primeira fonte é o trato intestinal humano. As bactérias vivem naturalmente junto com outras, como E. coli e Klebsiella. Sua ação é ajudar a decompor alimentos para que o corpo absorva os nutrientes. Quando o corpo excreta resíduos, a bactéria está presente nas fezes junto com outras.
Estações de tratamento de esgoto contêm Proteus mirabilis, conforme notado pelos pesquisadores Williams e Stahl em estudo para a revista "Applied Environmental Microbiology" (março de 1981). Isso é esperado, pois resíduos humanos vão para essas estações. O problema é se uma única bactéria escapa, podendo infestar a vida selvagem local. A disseminação por colonização é atributo comum a todas as bactérias.
Proteus mirabilis foi encontrada em fezes de camundongos e ratos. Como a bactéria infectou os roedores é interessante. Em estudo do pesquisador F. Wesnick (janeiro de 1961, "Journal of Pathology and Bacteriology", Escócia), descobriu-se que a bactéria foi inalada. Antes, presumia-se que a entrada ocorria pela ingestão de alimentos contaminados.
Em estudo publicado em 2010 na Universidade da Califórnia em Davis, pesquisadores (Scott F. Beckerman e colegas) identificaram Proteus mirabilis em fezes de gaivotas. Beckerman citou estudo do departamento de saúde do Condado de Lake, Illinois (2008), onde bactérias foram encontradas em fezes. Essa região fica ao norte de Chicago; praias são fechadas durante picos de contagem bacteriana.