Frank Baldino Jr., Ph.D. em farmacologia pela Temple University, fundou a Cephalon em Frazer, Pensilvânia, em 1987. A empresa recebeu sua primeira aprovação do FDA para novo medicamento em 1998 e atualmente emprega 3.000 pessoas mundialmente.
Em julho de 2009, o portfólio da Cephalon nos EUA consistia nos seguintes medicamentos:
Através da filial Cephalon Europe, sediada na Inglaterra, a empresa fornece mais de 30 medicamentos na África, Europa e Oriente Médio. Este portfólio inclui os medicamentos dos EUA, além de Abelcet (complexo lipídico de anfotericina B), Myocet (doxorrubicina liposomal), Naxy (claritromicina), Otrasel/Zelapar (selegilina), Spasfon (floroglucinol) e Targretin (bexaroteno).
A Cephalon tem medicamentos em desenvolvimento para leucemia mielóide aguda, Alzheimer, transtorno bipolar, linfoma de grandes células, lúpus, linfoma de células do manto, distúrbios mieloproliferativos, mieloma múltiplo, linfoma não-Hodgkin, dor pós-operatória, esquizofrenia, câncer de pequenas células do pulmão e tumores sólidos. Completam o portfólio dois analgésicos opioides resistentes a adulteração.
A Cephalon ficou em 903º na lista da Forbes de maiores empresas em 2008 e 10º entre farmacêuticas. Por outro lado, apenas um produto, Provigil, entrou no top 100 de medicamentos mais rentáveis em 2008. A empresa incorreu em quase US$ 440 milhões em encargos legais ao acertar acusações de promoção inadequada de alguns fármacos. Ainda assim, reportou em 12/02/2009 que vendeu US$ 1,9 bilhão em fármacos no ano anterior, com lucro ajustado por ação de US$ 5,39. O lucro por ação em 2007 foi US$ 4,60. As ações da Cephalon são negociadas na NASDAQ. Fecharam a US$ 53,28 em 10/07/2009.
A Cephalon opera a CIMA Labs como subsidiária integral para desenvolver novas tecnologias de liberação de fármacos. Também licencia produtos da Eurand (Amrix) e Immupharma (candidato para lúpus), e financia o desenvolvimento de agente de imagem por ultrassom da Acusphere. Mais recentemente, em maio de 2009, a Cephalon adquiriu participação de controle na firma australiana de biotecnologia Arana Therapeutics.