O objetivo da coloração ácido-resistente é separar ou diferenciar organismos ácido-resistentes de não ácido-resistentes. Esses organismos não respondem a corantes como organismos regulares, sendo difíceis de observar ao microscópio. A coloração ácido-resistente pode corar esses organismos para observação em testes médicos, como determinar níveis de certas bactérias e microrganismos em pacientes com HIV. Mycobacterium e Nocardia são dois exemplos específicos de organismos ácido-resistentes geralmente testados.
A maioria das bactérias é corada com corante de Gram ou etanol para observação ao microscópio. Células ácido-resistentes, como micobactérias, resistem à coloração com corante de contraste devido ao conteúdo lipídico na parede celular. Como resultado, procedimento especial deve ser feito para corar essas células difíceis. Existem três técnicas que aplicam corante a essas bactérias ácido-resistentes, capazes de mudar o pigmento das células apesar da resistência ao corante. São: coloração de Ziehl-Neelsen, coloração de Kinyoun e coloração por fluorocromo. Esses métodos criam pigmentação mais permanente, e bactérias ácido-resistentes permanecem coradas por mais tempo que células coradas com corante tradicional.
Distinta por usar calor para corar bactérias ácido-resistentes. É técnica de duas etapas. Amostra bacteriana é saturada com corante carbol-fucsina na primeira etapa. A lâmina com corante é então aquecida. Durante aquecimento, bactérias ácido-resistentes perdem cor e assumem a do carbol-fucsina (geralmente vermelho). Após concluído, substância de azul de metileno é aplicada. O azul não liga às bactérias ácido-resistentes devido aos lipídios na parede celular, mas liga a outros organismos na lâmina. Resultado: bactérias ácido-resistentes coradas de vermelho e outros organismos de azul. Os dois organismos agora podem ser distinguidos pela cor ao microscópio.
Não utiliza calor. Em vez disso, usa corante de fusão muito mais forte e concentrado. Este corante concentrado liga-se apenas a bactérias ácido-resistentes, enquanto corante de cor diferente liga-se apenas a organismos não ácido-resistentes. Novamente, duas cores resultam, permitindo distinção ao microscópio.
Usa técnica diferente de leitura dos resultados. Dois tipos de corante são aplicados, resultando em organismos ácido-resistentes e não ácido-resistentes de cores diferentes. Porém, o corante aplicado aos organismos ácido-resistentes é fluorocromo, que é fluorescente. Microscópio fluorescente especial é usado para ler resultados, identificando o corante fluorescente que corou apenas organismos ácido-resistentes.
A técnica é usada em testes para doenças causadas por micobactérias. Micobactérias causam infecções com sintomas semelhantes à tuberculose. Tipicamente, aparecem apenas em pessoas com sistema imunológico enfraquecido, como pacientes com HIV ou AIDS.