Existem dois procedimentos principais comumente usados para realizar testes de paternidade. O primeiro envolve uma tecnologia que amplifica o ácido desoxirribonucleico (DNA) chamada reação em cadeia da polimerase (PCR). O segundo envolve a análise de polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição; isso também é conhecido como criação de uma "impressão digital de DNA".
Primeiro, o DNA é obtido tanto da criança quanto do suposto pai através de swab bucal (esfregaço na boca) e isolamento de células dos fluidos coletados.
O DNA do homem e da criança é cortado em seções por enzimas. Estas seções são então amplificadas — ou multiplicadas — usando o procedimento PCR.
Marcadores fluorescentes que se ligam a sequências específicas do DNA são aplicados às seções. Se o homem for o pai da criança, seus DNAs conterão padrões semelhantes de fluorescência.
Neste método, o DNA do homem e da criança são cortados usando enzimas especiais chamadas enzimas de restrição. Os fragmentos resultantes são separados por tamanho usando uma tecnologia chamada eletroforese em gel.
Se os padrões de gel formados pelos fragmentos de DNA mostrarem um certo grau de similaridade entre as impressões digitais do homem e da criança, o homem será declarado pai da criança.