No método de zonas úmidas para tratamento de esgoto, as plantas desempenham papel crucial na limpeza da água, tornando-a segura para uso humano. As plantas típicas de zonas úmidas absorvem nitratos presentes no esgoto. Em suas raízes vivem bactérias benéficas, algas, fungos e outros microrganismos responsáveis pela troca de dióxido de carbono/oxigênio, amônio/nitrato e remoção de fosfato. Até o solo das zonas úmidas absorve metais pesados e outros materiais após sedimentarem no fundo da água parada.
As zonas úmidas fornecem uma barreira transicional natural entre terra e água. Assim como os tanques de filtração em estações de tratamento, as plantas e o solo nessa barreira removem metais e químicos nocivos da água antes que ela chegue a lagos ou oceanos.
As plantas aquáticas que ocorrem naturalmente como filtros em zonas úmidas também são usadas para filtrar esgoto. São elas: taboas, junços, lente-de-água e jacintos-d'água. Suas raízes absorvem nitrogênio e metais pesados, que são transportados para caules e folhas. As raízes também promovem o crescimento de microrganismos benéficos que consomem nutrientes tóxicos, como amônio e certos fosfatos. Esses microrganismos liberam nitratos e oxigênio na água. As plantas consomem os nitratos, e peixes e outros animais aquáticos usam o oxigênio para respirar.
Certas plantas toleram melhor a filtração do que outras, mas, em geral, as listadas vivem todo seu ciclo de vida sem efeitos negativos. Quando morrem naturalmente, sua reposição é muito mais barata do que substituir e manter tanques de filtração em condições adequadas.
Plantas aquáticas também filtram outros tipos de águas poluídas. Zonas úmidas artificiais criam uma barreira viva que impede a entrada de escoamento tóxico em oceanos, lagos, rios e córregos. Essas águas residuais incluem escoamento pluvial, efluentes agrícolas, drenagem de minas de carvão, resíduos de refinarias de petróleo, lixiviados de compostagem e aterros, e descargas de viveiros de peixes. Plantas aquáticas também podem filtrar efluentes industriais pré-tratados de fábricas de papel, têxteis e processamento de frutos do mar.
Essas zonas úmidas artificiais não apenas tornam a água segura, mas também criam um belo ecossistema para a vida selvagem prosperar. Muitos habitats para aves aquáticas, tartarugas, peixes e anfíbios foram recuperados com a criação de zonas úmidas em áreas antes degradadas por degradação urbana ou lixões. Essas zonas úmidas economizam dinheiro às comunidades e fornecem reservas naturais. Esses parques oferecem às pessoas locais para observar pássaros ou fazer piqueniques. Aves migratórias adoram esse novo desenvolvimento e tornaram essas zonas úmidas paradas comuns em suas viagens pelo globo.