Grupos de defesa de pacientes recomendam médicos com experiência específica no tratamento. Como sintomas imitam outras doenças e o teste de sangue padrão pode dar falsos negativos, um médico com expertise para considerar sintomas clínicos além de exames de sangue pode ser preferível. LLMDs podem oferecer tratamento mais longo com doses maiores de antibióticos até que todos os sintomas desapareçam, prevenindo cronicidade. Provavelmente buscaram recursos sobre Lyme e fizeram cursos extras, como os da Sociedade Internacional de Doença de Lyme e Doenças Associadas (ILADS).
Médicos discordam sobre melhor tratamento, especialmente casos crônicos com sintomas neurológicos. Maioria adota padrões diagnósticos restritos do CDC para monitorar prevalência. Estes baseiam-se em espectro limitado de sintomas vistos principalmente no início. O Centro de Pesquisa de Doenças Transmitidas por Carrapatos da Columbia conclui que tais médicos podem falhar no diagnóstico de Lyme em estágio crônico, que não apresenta mais sintomas clássicos iniciais. LLMDs usam critérios mais amplos, incluindo resposta sintomática a antibióticos conhecidos por mitigar a doença. Muitos tratam casos crônicos suspeitos com antibióticos mesmo na ausência de sintomas iniciais exigidos pelo CDC. Esta abordagem intercepta casos crônicos fora dos padrões CDC, mas arrisca submeter pacientes sem Lyme a terapia antibiótica de longo prazo, com potenciais efeitos colaterais perigosos.
Como não existe teste de sangue definitivo para Lyme dentro de margens de erro aceitáveis, tanto padrões CDC quanto abordagem LLMD representam cuidados razoáveis. Porém, seguradoras exigem diagnóstico conforme padrões da Sociedade de Doenças Infecciosas da América (IDSA). A IDSA historicamente mantém que evidência para infecção crônica é inconclusiva e recomenda negar cobertura para terapia antibiótica de longo prazo prescrita por alguns LLMDs.
A aceitação prevalente dos padrões CDC e a forte posição da IDSA contra cobertura para Lyme crônica fazem muitos LLMDs adotarem postura discreta. Muitos temem prejuízo à carreira e negação de cobertura aos pacientes. Consequentemente, a maioria aceita novos pacientes apenas por indicação de associações de apoio a pacientes ou de outros pacientes.
A LDA é organização nacional sem fins lucrativos que promove conscientização. Sua ferramenta automatizada de indicação de médicos fornece nomes de LLMDs por CEP. Após registro e inserção do CEP, fornece três nomes e endereços aleatórios de LLMDs o mais próximo possível. Como não são distribuídos uniformemente, alguns pacientes podem precisar viajar.